En 1977, les statutes de la Fondation du Mérite européen furent profondément remaniés de manière à rendere les structures de cette dernière plus souples et plus efficaces. Un directoire, émanation du conseil d'administration, fur crée pour assurer la gestion des affaires courantes, couvrir les aspects exécutifs de la Fondation et préparer les décisions du conseil d'administration. Les administrateurs délégués et les présidents du conseil d'administration forment le dirctoire.

La Fondation du Mérite européen est gérée par un conseil d'administration composée vingt membres au maximum, d'origines et nationalités européennes diverses, dont la durée du mandat n'est pas limitée. Ce conseil prend ses décisions à la majorité de ses membres. Certaines décisions, rares et exceptionnelles, comme l'exclusion d'un membre, se prennent à l'unanimité. Pour la gestion des  affaires courantes, il choisit parmi ses membres ou plusieurs vice-présidents, ou plusieurs administrateurs délégues et, parmi ces derniers, il peut désigner un secrétaire générale et un trésorier. Certaines responsabilités, tels les aspects juridiques, les relations publiques, etc., sont attribuées à des membres spécialisés dans ces domaines. Il s'entoure également d'secrétariat. Il est investi des pouvoirs les plus étendus. Il approuve. notamment les propositions de décorations.